안녕하세요. 급하신것 같아 일단 아는대로 제가 답변 드려 보겠습니다.^^;;

<질문1>
이 질문은...가려저 보이는게 당연한 것이 아닌지요? 상단 기본GNB메뉴에서 겹친다면 문제지만서도
그 하위 메뉴가 나와서 가려지는 것은 문제가 아니라 봅니다.
만약 그것이 보기 싫으시다면은 하위 카테고리 생기는 것만큼 해당 "상품리스트"의 위치를 수정해주어야 할것 같습니다.

상품리스트 페이지 > 레이아웃 편집 > "쇼핑몰 레이아웃"의 녹색 "D"를 클릭 >
DIV 속성에서 적혀있는 style="margin:0 0 30px 0" 이 부분을
style="margin:100px 0 30px 0" 앞부분의 숫자를 원하시는 만큼 고쳐주세요. 상단 여백 수치입니다.

<질문2>
좌측에 메뉴가 나오는 이유는 레이아웃설정을 서브레이아웃 설정을 하셨기 때문입니다.
메뉴가 나오는게 싫으시다면 아래와 같이 따라주세요.

방법1. 게시판 편집 > 해당 만든게시판 클릭 > 하단부분 "디자인속성" 에서 쇼핑몰레이아웃 설정 > 저장

방법2. 이것은 원본레이아웃에서 수정하는 것입니다. 지금으로서는 비추천 입니다.
해당 게시판 목록페이지 화면에서 > 레이아웃 편집 > 해당 메뉴가 보이는 부분의 "D"를 클릭 >
항목 노출 체크해제 후 빈 공간에 1=2를 적어서 저장

<질문3>
우선 만들어 두신 "인기상품" 그룹의 url을 알아야 합니다.

관리자모드 > 쇼핑몰 > 그룹관리 > "인기상품"의 우측에 있는 보기를 클릭
url 주소를 복사하시고

링크를 거실 이미지가 있는 페이지에서
페이지 편집 > 해당 이미지 클릭 > 좌측 버튼/링크넣기 > 우측 내용에서
사용자 링크 부분에 복사해두었던 url을 붙여 넣고 저장